IV Jornadas Latinoamericanas de Bacteriófagos

El aumento de la resistencia a los antimicrobianos constituye un desafío global desde el enfoque One Health, que afecta a humanos, animales y al ambiente. Ante la disminución de las opciones terapéuticas, los bacteriófagos representan una alternativa prometedora; sin embargo, los mecanismos de defensa bacterianos y sus implicancias ecológicas generan preocupación. En este estudio se investigaron los mecanismos de defensa antífagos (APDM) en bacterias multirresistentes (MDR).

Se realizó secuenciación del genoma completo (WGS) utilizando plataformas Illumina y MinION Nanopore en aislamientos obtenidos de muestras clínicas de un hospital universitario en Uruguay, así como de muestras fecales de perros y gallinas. Los ensamblados híbridos se generaron mediante Unicycler y se emplearon ResFinder, PlasmidFinder y DefenseFinder para identificar genes de resistencia a antibióticos, grupos de incompatibilidad plasmídica y APDM.

Se analizaron 26 aislamientos que contenían 45 plásmidos pertenecientes a 17 grupos de incompatibilidad. Todos los aislamientos presentaron al menos tres APDM (media: 8 por aislamiento). En total, se identificaron 213 APDM correspondientes a 32 tipos diferentes. De los 45 plásmidos, 26 portaban 76 APDM, principalmente asociados a los grupos IncHI2A, IncN2, IncC, IncFII, IncT, IncQ, IncU, IncL/M, IncR, IncM, IncI1, IncI2 e IncFIB. Los plásmidos IncQ presentaron la mayor carga de APDM (8,5 por plásmido en promedio), seguidos por IncHI2A (3,5) e IncFIB, IncFIC e IncR (3 cada uno).

Los APDM más frecuentes incluyeron sistemas de restricción-modificación por metilación, sistemas toxina–antitoxina Mok-Hok-Sok dirigidos contra fagos T4 y sistemas MazEF que inhiben la propagación del fago P1. Los plásmidos que codifican APDM también portaban genes de resistencia a betalactámicos, aminoglucósidos, fluoroquinolonas, macrólidos, colistina, trimetoprim, sulfonamidas y cloranfenicol. La circulación de estos sistemas entre especies resalta la necesidad de un enfoque One Health y de estudios genómicos para optimizar la terapia fágica.