Congreso Uruguayo en Una Salud - I Jornada Académica del Instituto de Investigación Una Salud

La resistencia a los antimicrobianos (RAM) ha sido reconocida por la OMS y la FAO como una de las principales amenazas para la salud pública mundial, la sostenibilidad de los sistemas productivos y la seguridad alimentaria. Este fenómeno se define como la capacidad de los microorganismos para contrarrestar el efecto de los antimicrobianos utilizados para inhibir su crecimiento. Las bacterias portadoras de genes de RAM pueden causar infecciones tanto en seres humanos como en animales, incrementando el riesgo de propagación de enfermedades difíciles de tratar. El uso masivo de antibióticos en la producción animal constituye uno de los desafíos más relevantes dentro del enfoque Una Salud, debido a su contribución al desarrollo y diseminación de resistencia antimicrobiana, con impacto sobre la salud humana, animal y ambiental. Esta práctica favorece la aparición y transmisión de cepas resistentes, generando reservorios de bacterias portadoras de genes de RAM, incluso en ausencia de manifestaciones clínicas. Dichos reservorios pueden diseminarse al ambiente a través de las heces y efluentes agropecuarios, contaminando suelos y aguas destinadas al consumo o riego. En este contexto, el presente trabajo tiene como objetivo generar información sobre las comunidades microbianas asociadas a la materia fecal animal, presente en establecimientos de producción ganadera, tanto cárnica como lechera, de la región de la Cuenca del Río Santa Lucía (n = 30), e identificar potenciales especies patógenas. Además, se propone caracterizar los perfiles diferenciales de microorganismos (comensales y patógenos) y de genes asociados a resistencia antimicrobiana, virulencia y elementos genéticos móviles, comparando los distintos sistemas de producción (intensivo, extensivo, cárnico y lechero). Asimismo, se analizará la coocurrencia de potenciales patógenos y genes de RAM de relevancia clínica. La metodología comprende: (i) el relevamiento de las comunidades microbianas mediante tecnología de secuenciación Oxford Nanopore Technologies (ONT), aplicada al análisis de marcadores genéticos como el gen 16S rRNA. Esta estrategia permitirá obtener perfiles microbianos con resolución a nivel de especie y estimar parámetros de ecología microbiana, como la riqueza y la composición diferencial entre los sitios de muestreo, (ii) la caracterización de genes asociados a RAM, virulencia y al potencial de transferencia se realizará mediante el ensamblaje y análisis de datos de metagenómica shotgun en un subgrupo de sitios seleccionados. Se prevé que el trabajo contribuya a la optimización y estandarización de metodologías de monitoreo para la caracterización de las comunidades microbianas a partir de muestras fecales. Asimismo, se esperan obtener perfiles diferenciales de microorganismos, resistoma y viruloma asociados a los distintos sistemas de producción e identificar genes de RAM de relevancia clínica, principalmente en sistemas intensivos, vinculados a contextos plasmídicos, integrones y transposones. Finalmente, se buscará detectar la coocurrencia de estos genes y especies potencialmente patógenas, indicando la posible presencia de bacterias de importancia clínica. Esto permitirá elaborar recomendaciones que podrán guiar la toma de decisiones por parte de veterinarios y productores, así como fortalecer la sensibilización sobre la resistencia a los antimicrobianos.