Congreso Uruguayo en Una Salud - I Jornada Académica del Instituto de Investigación Una Salud

Las infecciones intrahospitalarias o nosocomiales (IN) constituyen una problemática global que impacta directamente sobre la morbi-mortalidad de los pacientes, prolonga la estadía hospitalaria y eleva los costos de tratamiento. La ocurrencia de estas infecciones está mayormente asociada con el contacto directo entre pacientes, personal de salud o equipamiento médico que atraviesa las barreras naturales del organismo. A su vez, los microorganismos presentes en el ambiente hospitalario están expuestos a una elevada presión selectiva derivada del uso intensivo de antimicrobianos, lo que favorece la aparición y persistencia de cepas multirresistentes. En este contexto, el monitoreo ambiental de patógenos y de genes de resistencia antimicrobiana representa una medida con potencial para la vigilancia epidemiológica y la gestión del riesgo hospitalario. Tradicionalmente, este tipo de estudios se basan en métodos dependientes de cultivo, que si bien son robustos, están limitados a la detección de bacterias actualmente cultivables. En contraste, las tecnologías moleculares, como la PCR y la secuenciación masiva de amplicones (NGS), permiten una detección rápida, con gran sensibilidad y no son dependientes de cultivo, ampliando el espectro de microorganismos detectables. En el presente trabajo se desarrolló e implementó una herramienta basada en paneles de secuenciación masiva de amplicones de la tecnología AmpliSeq, diseñada para la detección simultánea de microorganismos de interés clínico. Se llevaron a cabo tres muestreos trimestrales en dos unidades de cuidados intensivos (UCI), abarcando seis habitaciones por unidad y diez superficies por habitación, además de los carros comunes. El ADN extraído de las superficies se agrupó por habitación para obtener un perfil representativo del ambiente. El panel personalizado, desarrollado en el marco del proyecto, posee 257 pares de cebadores para la detección de un total de 40 microorganismos de interés clínico. Como blancos se utilizaron marcadores de virulencia únicos hallados en la literatura para garantizar especificidad y sensibilidad. En paralelo, se aplicó también el panel comercial “AMR Research Panel” para caracterizar el resistoma asociado a las superficies de las habitaciones estudiadas. Esta aproximación permitió detectar de manera consistente y repetida patógenos del grupo ESKAPE como lo son Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa, Acinetobacter baumannii, Enterococcus faecium y Enterobacter spp. a lo largo de los nueve meses de monitoreo. Además, se identificaron genes de resistencia de amplio espectro, incluyendo blaVIM, blaOXA, blaTEM, blaNDM y blaKPC, los cuales se asocian a la resistencia a carbapenémicos. Los resultados sugieren que la herramienta desarrollada posee la capacidad de detectar patógenos intrahospitalarios con una alta sensibilidad, y por ende, que posee características deseables para el monitoreo ambiental de patógenos en entornos hospitalarios. Su aplicación en conjunto con el panel comercial permite obtener información integrada sobre la presencia y persistencia de microorganismos clínicamente relevantes y las resistencias móviles presentes en el ambiente, aportando una base objetiva para la toma de decisiones en medidas para reducir el riesgo de ocurrencia de las IN y hacer un mejor uso de antibióticos en el UCI.